Le bâtiment a la forme d'un triangle émoussé et est situé à deux kilomètres au nord-ouest des pyramides de Gizeh, près de la jonction de l'autoroute Le Caire-Alexandrie.
Les murs nord et sud du bâtiment font face à la pyramide de Khéops et à la pyramide de Menkaure. Devant le bâtiment se trouve une grande place plantée de palmiers dattiers.
L'une des principales caractéristiques du musée est le mur en pierre d'albâtre translucide qui forme la façade du bâtiment. À l'intérieur, l'entrée principale s'ouvre sur un grand atrium qui mène aux salles d'exposition du musée.
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